Ðàçâèòèå ñþæåòà íà÷èíàåòñÿ ñ äèíàìè÷íûõ ñîáûòèé. Ñòàâ ïðåäâîäèòåëåì ñîáñòâåííûõ êëîíîâ, Ýëèñ ðåøàåò íàâñåãäà îñâîáîäèòü ìèð îò ÷óäîâèùíîé êîðïîðàöèè Àìáðåëëà, êîòîðàÿ ïðîäîëæàåò ïðîâîäèòü ýêñïåðèìåíòû íàä ÷åëîâå÷åñòâîì. Ïðàâäà, íà ñåé ðàç îíè òùàòåëüíî ïðîäóìàëè ñðåäñòâî íàäåæíîãî óêðûòèÿ è ðàñïîëîæèëèñü â áóíêåðå ïîä Òîêèî. Íî áîåâîé íàñòðîé Ýëèñ âïå÷àòëÿåò ìàñøòàáàìè ïëàíîâ. Âìåñòå ñ àðìèåé êëîíîâ åé óäàåòñÿ ïðîíèêíóòü â ïîäçåìíîå óáåæèùå, ÷òîáû ëèêâèäèðîâàòü âñåõ, êòî ïðè÷àñòåí ê èçîáðåòåíèþ ñìåðòåëüíîé âàêöèíû. Åé óäàåòñÿ ðåàëèçîâàòü çàäóìàííîå. Íî îñíîâíîé ìèøåíüþ îñòàâàëñÿ ïðåäñåäàòåëü êîìïàíèè - Àëüáåðò Âåñêåð. Åìó óäàëîñü ñêðûòüñÿ ñ ìåñòà íà êîíâåðòîïëàíå. Îäíàêî, íàìåðåíèÿ Ýëèñ íåñîêðóøèìû. Ïîòîìó îíà ñëåäóåò çà Àëüáåðòîì. Çàâÿçàâøàÿñÿ ïîòàñîâêà â êîíâåðòîïëàíå çàêàí÷èâàåòñÿ òåì, ÷òî Àëüáåðò ââîäèò ãåðîèíå ñûâîðîòêó, íåéòðàëèçóþùóþ ñâåðõ ñïîñîáíîñòè. À âñêîðå êîíâåðòîïëàí ðàçáèâàåòñÿ âäðåáåçãè. ×óäîì óöåëåâøàÿ Ýëèñ íå îáíàðóæèâàåò îñòàíêîâ Âåñêåðà. Æèâ ëè îí?